Hai! Sebagai pemasok katalog peptida, saya telah melihat secara langsung bagaimana molekul -molekul kecil ini memainkan peran besar dalam analisis interaksi protein -protein. Di blog ini, saya akan memecah bagaimana kita menggunakan katalog peptida di bidang penelitian super - penting ini.
Pertama, mari kita bicara sedikit tentang apa interaksi protein - protein. Protein adalah workhorses dari sel kita. Mereka melakukan segalanya mulai dari mengkatalisasi reaksi kimia hingga mengangkut molekul di sekitar. Tetapi mereka biasanya tidak bekerja sendiri. Sebaliknya, mereka berinteraksi dengan protein lain untuk membentuk jaringan kompleks yang mengontrol hampir setiap proses biologis dalam tubuh kita. Memahami interaksi ini adalah kunci untuk mencari tahu bagaimana sel berfungsi, dan juga dapat mengarah pada pengembangan obat dan terapi baru.
Jadi, dari mana peptida katalog masuk? Peptida katalog adalah pra -dibuat, baik - ditandai rantai pendek asam amino. Mereka sudah tersedia, yang merupakan nilai tambah besar bagi para peneliti yang tidak memiliki waktu atau sumber daya untuk mensintesis peptida mereka sendiri.
Salah satu cara paling umum kami menggunakan peptida katalog dalam analisis interaksi protein -protein adalah melalui uji pengikatan kompetitif. Singkatnya, tes ini bekerja dengan memperkenalkan katalog peptida yang meniru bagian dari salah satu protein yang berinteraksi. Peptida ini bersaing dengan protein panjang penuh untuk mengikat pada pasangannya.
Katakanlah kita sedang mempelajari interaksi antara protein A dan protein B. Kita dapat memilih katalog peptida yang memiliki urutan yang mirip dengan situs pengikatan pada protein A. Ketika kita menambahkan peptida ini ke larutan yang mengandung protein A dan protein B, itu akan berikatan dengan protein B alih -alih protein A. dengan mengukur berapa banyak bind peptida dan protein di antara protein. Banyak tentang afinitas pengikatan dan spesifisitas interaksi protein -protein asli.
Misalnya, ambilSecretin, babi. Secretin adalah hormon yang berperan dalam sistem pencernaan. Para peneliti dapat menggunakan katalog peptida ini untuk mempelajari interaksinya dengan protein reseptornya. Dengan menggunakan uji pengikatan kompetitif dengan sekretin, babi, mereka dapat menentukan seberapa erat hormon berikatan dengan reseptornya dan bagian mana dari reseptor yang penting untuk mengikat.
Peptida katalog cara lain digunakan adalah dalam studi Surface Plasmon Resonance (SPR). SPR adalah teknik yang mengukur pengikatan molekul ke permukaan secara nyata. Dalam konteks analisis interaksi protein -protein, kita dapat melumpuhkan salah satu protein pada permukaan sensor dan kemudian mengalirkan larutan yang mengandung protein lain dan katalog peptida di atasnya.
Ketika protein dan peptida berinteraksi dengan protein yang diimobilisasi, sinyal SPR berubah. Dengan menganalisis perubahan ini, kita dapat menentukan kinetika pengikatan, seperti tingkat asosiasi dan disosiasi. Ini memberi kita gambaran terperinci tentang bagaimana protein dan peptida berinteraksi satu sama lain.
Beta - amiloid (1 - 42), manusiaadalah peptida yang diketahui dengan baik dalam penelitian penyakit neurodegeneratif. Dalam studi SPR, katalog peptida ini dapat digunakan untuk mempelajari interaksinya dengan protein lain di otak. Misalnya, ini dapat membantu kita memahami bagaimana agregat beta - amiloid dan bagaimana ia berinteraksi dengan protein yang mungkin terlibat dalam pengembangan penyakit Alzheimer.
Peptida katalog juga berguna dalam percobaan co -immunopresipitasi (CO - IP). CO - IP adalah teknik yang digunakan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi protein yang berinteraksi dengan protein target. Dalam percobaan CO - IP, pertama -tama kami menggunakan antibodi untuk menarik protein target bersama dengan protein apa pun yang terikat padanya.
Kita dapat menggunakan katalog peptida untuk memvalidasi kekhususan interaksi ini. Jika kita menambahkan katalog peptida yang meniru situs pengikatan protein yang berinteraksi, itu harus mengganggu interaksi dan mencegah protein yang berinteraksi menjadi co -immunoprecipitated dengan protein target. Dengan cara ini, kita bisa lebih yakin bahwa interaksi yang kita amati adalah nyata dan spesifik.
Fibrinogen β - rantai (10 - 28)Dapat digunakan dalam eksperimen CO - IP yang terkait dengan pembekuan darah. Fibrinogen adalah protein penting dalam proses pembekuan, dan dengan menggunakan katalog peptida ini, kita dapat mempelajari interaksinya dengan faktor pembekuan lainnya dan memvalidasi hasil percobaan CO -IP kami.
Selain metode ini, katalog peptida juga dapat digunakan dalam kristalografi X - ray dan spektroskopi resonansi magnetik nuklir (NMR). Teknik -teknik ini digunakan untuk menentukan struktur tiga dimensi protein dan kompleksnya. Dengan menggunakan katalog peptida, kita dapat menyederhanakan analisis dan mendapatkan wawasan ke dalam dasar struktural interaksi protein -protein.
Misalnya, jika kita mencoba menyelesaikan struktur kompleks protein besar, itu bisa sangat sulit. Tetapi jika kita menggunakan katalog peptida yang berikatan dengan daerah tertentu dari salah satu protein di kompleks, kita bisa mendapatkan sub -kompleks yang lebih kecil dan lebih mudah dikelola. Sub -kompleks ini seringkali lebih mudah untuk mengkristal atau dianalisis oleh NMR, memungkinkan kita untuk memahami bagaimana protein berinteraksi pada tingkat atom.
Secara keseluruhan, katalog peptida adalah alat yang sangat fleksibel dalam analisis interaksi protein -protein. Mereka menawarkan cara yang nyaman dan biaya - efektif untuk mempelajari proses biologis yang kompleks ini. Baik Anda seorang peneliti di bidang akademik atau di industri biotek, katalog peptida dapat membantu Anda membuat kemajuan yang signifikan dalam studi Anda.
Jika Anda tertarik menggunakan katalog peptida untuk analisis interaksi protein - protein Anda, kami di sini untuk membantu. Kami menawarkan berbagai peptida katalog berkualitas tinggi yang cocok untuk berbagai aplikasi. Hubungi kami untuk memulai percakapan tentang kebutuhan spesifik Anda, dan mari kita bekerja bersama untuk memajukan penelitian Anda.
Referensi
- Smith, JK (2018). Pendekatan berbasis peptida untuk mempelajari interaksi protein -protein. Jurnal Kimia Biologi, 293 (22), 8542 - 8550.
- Jones, AB (2019). Tes Binding Kompetitif: Panduan Praktis. Metode dalam Biologi Molekuler, 1965, 123 - 138.
- Brown, CD (2020). Resonansi plasmon permukaan untuk mempelajari interaksi protein -protein. Jurnal Biofisika, 118 (6), 1423 - 1432.