Glosarium

2-Abz - 2-Aminobenzoyl, biasanya bergabung dengan 2,4-dinitrofenil (Dnp) atau 3-nitro-tirosin (NitroTyr) untuk membentuk pasangan Fluorofor/Quencher. eksitasi pada 320 nm, emisi pada 420 nm.

3-Abz (asam m-aminobenzoat) dapat dilihat sebagai asam -amino. Ketika asam m-aminobenzoat dimasukkan ke dalam rantai peptida, ini menghasilkan putaran yang kaku.

4-Abz (asam p-Aminobenzoic, PABA), yang merupakan turunan asam benzoat alami, juga dapat digunakan sebagai penjarak linier kaku.

Abu, L- -Aminobutyryl ((S)-2-Amino-butanoyl), -aminobutyric acid, merupakan turunan asam amino. Karena kemiripan strukturalnya dengan asam amino alami, asam amino ini sering digunakan dalam desain dan sintesis peptida dan mimetik peptida.

Ac mewakili asetil. Asetilasi N-terminal adalah modifikasi penstabil umum untuk peptida di alam.

Acm, Acetamidomethyl, dapat dihilangkan dengan menggunakan Hg(II) atau Ag(I). Ini adalah salah satu kelompok pelindung tiol yang umum digunakan untuk sistein ketika mensintesis peptida dengan banyak ikatan disulfida.

ACTH (hormon adrenokortikotropik) adalah hormon yang disekresi oleh hipofisis anterior yang merangsang korteks adrenal untuk memproduksi kortikosteroid.

Aad (L- -asam aminoadipat) adalah asam amino non-proteinogenik. Strukturnya mirip dengan asam glutamat (Glu), dengan tambahan gugus metilen pada rantai sampingnya.

(2-Aminoethoxy)acetic acid, juga dikenal sebagai glisin etil ester atau glisin etilamid, dapat digunakan sebagai pengatur jarak atau penghubung dalam sintesis modifikasi peptida.

1-(1'-adamantyl)-1-metil-etoksikarbonil, gugus pelindung amino yang sangat labil terhadap asam dalam sintesis peptida, dapat dideproteksi dengan 3% TFA/CH2Cl2

AFC (7-Amino-4-trifluoromethylcoumarin) adalah senyawa fluoresen dengan eksitasi kumarin yang dilepaskan pada 395-400 nm, emisi pada 495-505 nm.

Spesies dengan berat molekul lebih tinggi terbentuk karena adhesi non-kovalen dari spesies yang lebih kecil. Khususnya pada protein, agregasi adalah suatu bentuk denaturasi yang dapat terjadi pada permukaan nonpolar dengan struktur sekunder, seperti struktur yang biasanya membentuk interaksi intramolekul dan terkubur dalam heliks dan lembaran protein. Molekul berinteraksi satu sama lain, terkadang membentuk bentuk polimolekul yang tidak larut. Agregasi berbeda dengan oligomerisasi, interaksi normal protein asli yang terlipat dengan benar untuk membentuk polimer tingkat tinggi.

AHX, Aminohexanoyl,6-asam amino heksanoat, juga disingkat Aca atau LC, Biasanya diperkenalkan sebagai pengatur jarak non-polar pendek antara biotin, fluorofor, dan rangkaian peptida.

2-Asam aminoisobutirat adalah asam amino non-protein langka yang merupakan produk akhir metabolisme pirimidin dan dikeluarkan melalui urin dan terdapat dalam beberapa antibiotik yang berasal dari jamur. Juga digunakan untuk menggantikan asam amino alami untuk sintesis peptida.

Alkohol adalah senyawa organik yang dicirikan oleh adanya satu, dua atau lebih gugus hidroksil (−OH) yang terikat pada atom karbon dalam gugus alkil atau rantai hidrokarbon. Alkohol peptida adalah senyawa penting secara klinis yang kurang diselidiki dalam studi hubungan struktur-aktivitas (SAR) untuk penemuan obat. Misalnya, DAMGO adalah agonis reseptor opioid yang dimodifikasi oleh alkohol di terminal-C, dengan rangkaian Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Ia memiliki selektivitas dan afinitas yang tinggi terhadap reseptor μ-opioid.

Aldehida adalah senyawa organik yang gugus karbonilnya terikat pada atom karbon di ujung rantai karbon. Aldehida peptida adalah alat penting dalam biokimia dan biologi kimia untuk penghambatan dan penonaktifan kimiawi protease.

Aloc - Allyloxycarbonyl, gugus pelindung amino (juga disingkat Alloc). Proteksi dapat dihilangkan dengan Pd(PPh3)4.

Penyakit Alzheimer, ditandai dengan plak -amiloid dan tau kusut, disebabkan oleh disfungsi sinaptik dan masalah jalur pembersihan, yang menyebabkan gangguan kognitif.

7-Amino-4-methylcoumarin (AMC) adalah probe fluoresen yang umum untuk pelabelan peptida dalam studi protease. Konjugasinya dengan peptida memadamkan sinyal fluoresen, dan AMC yang dilepaskan pada pembelahan protease dapat mengukur aktivitas enzim, dengan eksitasi/emisi maksimal 345/445 nm. Misalnya, peptida fluoresen substrat yang disukai untuk menentukan aktivitas mirip trypsin dari proteasome yang dimurnikan, dengan urutan: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Atrial natriuretic peptida (ANP), hormon yang diproduksi dan dilepaskan oleh atrium jantung sebagai respons terhadap peningkatan volume dan tekanan darah. Berfungsi untuk mengatur keseimbangan cairan dan tekanan darah dengan meningkatkan vasodilatasi, meningkatkan produksi urin (diuresis), dan mengurangi reabsorpsi natrium di ginjal. Tindakan ini membantu melawan efek tekanan darah tinggi dan kelebihan cairan dalam tubuh.

Peptida antigenik adalah rangkaian asam amino pendek yang berasal dari protein atau biomolekul lain yang memicu respons imun suatu organisme. Peptida ini dikenali oleh sistem kekebalan sebagai benda asing atau asing bagi tubuh, sehingga menyebabkan aktivasi sel kekebalan seperti sel T dan sel B. Peptida antigenik memainkan peran penting dalam respon imun, termasuk produksi antibodi adaptif dan pengembangan memori imun. Mereka dipelajari secara luas dalam imunologi dan pengembangan vaksin karena potensinya memicu respons imun spesifik terhadap patogen atau sel abnormal.

Sintesis peptida asimetris dengan 2, 4, dan 8 cabang dapat dicapai dengan memasukkan lisin, arginin, atau asam glutamat secara strategis ke dalam rangkaian peptida.

Dimethylarginine asimetris (ADMA, Arg(Me)2) adalah senyawa kimia alami dan penghambat endogen nitric oxide synthase (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (asimetris) dapat langsung digunakan untuk sintesis peptida yang mengandung dimetilarginin asimetris.

5-Asam aminovalerat, dapat digunakan sebagai pengatur jarak atau penghubung dalam sintesis modifikasi peptida.

Benzyloxymethyl (Bom) adalah gugus pelindung imidazol yang labil asam yang digunakan dalam proses Boc-SPPS untuk peptida yang mengandung histidin. Benzyloxymethyl menghasilkan formaldehida yang sangat reaktif setelah diolah dengan asam. Oleh karena itu, Bom paling baik dibelah dengan adanya Cys, methoxyamine atau senyawa lain yang bereaksi dengan aldehida.

-Asam amino memiliki gugus amino yang terikat pada -karbon, yang merupakan atom karbon kedua yang jauh dari gugus karboksil. Rumus struktur umum asam -amino dapat direpresentasikan sebagai: R−CH(NH2)−COOH

Peptida natriuretik tipe B (BNP), hormon yang diproduksi terutama oleh ventrikel jantung sebagai respons terhadap peregangan berlebihan sel otot jantung. Ini memainkan peran penting dalam mengatur tekanan darah dan keseimbangan cairan, terutama dengan meningkatkan vasodilatasi dan meningkatkan ekskresi natrium melalui ginjal.

t-Butiloksikarbonil (Boc) adalah gugus pelindung yang sangat labilea-amino dalam sintesis peptida, dapat dibelah oleh TFA/metilen klorida (1:1), HCl dalam etil asetat atau dioksan, asam format 98%.

2-(4-Biphenylyl)isopropyloxycarbonyl (Bpoc) adalah gugus pelindung amino-labilea yang sangat asam dalam sintesis peptida, dapat dibelah dengan 1% TFA/metilen klorida.

Peptida dengan 2, 4, dan 8 cabang dapat diperoleh dengan memasukkan lisin, arginin, atau asam glutamat secara strategis ke dalam rangkaian peptida.

t-Butyldimethylsilyl (TBS atau TBDMS) adalah gugus pelindung hidroksil yang kompatibel dengan Fmoc-SPPS. Ia labil terhadap asam dan dapat dipecah secara selektif oleh ion fluorida.

Benzoil adalah gugus asil yang sering dimasukkan pada ujung-N peptida. Ini kurang polar dibandingkan asetil (Ac) dan dapat menjadi modifikasi permanen.

Benzil (Bzl) residu alkil dan gugus pelindung rantai samping yang digunakan untuk memblokir alkohol (Ser, Thr, Hyp) dalam sintesis peptida. ia dapat dipecah dengan asam kuat atau hidrogenolisis katalitik (misalnya hidrogen/Pd).

Cholecystokinin (CCK) adalah hormon peptida yang diproduksi oleh mukosa usus bagian atas dan ditemukan di sistem saraf pusat. Ini merangsang kontraksi kandung empedu, pelepasan enzim pankreas, dan mempengaruhi berbagai proses pencernaan.

Peptida terkait gen kalsitonin (CGRP) adalah 37-peptida asam amino yang terkait dengan kalsitonin, amylin, dan adrenomedullin. Ia ada dalam dua bentuk, -CGRP (CGRP I) dan -CGRP (CGRP II), dengan aktivitas biologis yang serupa. CGRP terutama ditemukan di neuron sensorik dan sentral, mempengaruhi fungsi kardiovaskular, metabolisme kalsium, dan tonus pembuluh darah fetoplasenta. Reseptornya berpasangan dengan G-protein dan mengaktifkan adenilat siklase, berinteraksi dengan protein pengubah aktivitas reseptor (RAMPs) untuk spesifisitas ligan dan perdagangan seluler.

L-Cyclohexylalanine (Cha) adalah analog asam amino non-polar dari fenilalanin, dimana cincin aromatik digantikan oleh cincin sikloheksana. Substitusi ini memungkinkan mempelajari peran asam amino aromatik dalam interaksi seperti interaksi π-π dengan mengganti residu fenilalanin dengan Cha dalam percobaan.

L- -Sikloheksilglisin (Chg) adalah asam amino non-polar yang terhambat secara sterik. Ini berfungsi sebagai perantara farmasi yang signifikan dan juga ditemukan dalam produk alami.

Kolesterol diproduksi secara alami oleh hati dan sel lain di dalam tubuh, namun bisa juga berasal dari makanan yang kita konsumsi, terutama dari produk hewani seperti daging, unggas, dan produk susu berlemak penuh. Kolesterol dapat dikaitkan dengan peptida untuk meningkatkan farmakokinetik.

cis-Hydroxyproline, stereoisomer trans-hidroksiprolin alami.

Citrulline hadir dalam protein sebagai hasil modifikasi enzimatik residu arginin pasca-translasi.

CMK adalah inhibitor RSK2 kinase dengan potensi serupa tetapi stabilitas kimianya lebih rendah dibandingkan FMK.

Peptida natriuretik tipe C (CNP) adalah peptida oleh sel endotel vaskular, yang dikenal karena efek vasodilatasinya. Ini menunjukkan kesamaan struktural dan fisiologis dengan peptida natriuretik atrium dan otak (ANP dan BNP).

L- -Siklopentilglikil (Cpg), adalah asam amino non-polar yang terhambat secara sterik.

Dalam urutan peptida, residu unik yang dihubungkan ke urutan linier oleh gugus aminonya, meninggalkannya dengan gugus karboksi bebas. Gugus karboksil residu ini dapat mengalami modifikasi seperti tengahasi atau, dalam kasus seperti piroglutamat, laktamisasi internal.

Sianin 3 adalah pewarna sianin berpendar merah yang umumnya tereksitasi oleh sumber cahaya sekitar 558 nm dan memancarkan cahaya pada sekitar 572 nm.

Cyanine 5 adalah fluorophore pewarna sianin yang memancarkan fluoresensi inframerah-dekat yang biasanya tereksitasi oleh sumber cahaya sekitar 646 nm dan memancarkan cahaya pada sekitar 664 nm.

Asam L-, -Diaaminobutyric adalah asam ,ω-diamino, analog yang lebih pendek dari ornitin (Orn) dan lisin (Lys). Dengan perlindungan yang tepat, asam ω-diamino dapat dimodifikasi secara selektif pada posisi Nω atau digabungkan untuk membuat peptida atau dendrimer bercabang.

3-(Dimethylaminoazo)benzene-4-asam karboksilat, adalah kromofor yang terikat pada gugus amino yang digunakan dalam aplikasi biokimia dan biologi molekuler sebagai pemadam dalam transfer energi resonansi fluoresensi (FRET), misalnya dengan EDANS. Eksitasi DABCYL pada 454 nm.

Dabsyl ,4-dimethylaminobenzenesulfonyl klorida, Kromofor yang terikat pada gugus amino yang digunakan sebagai pemadam dalam kombinasi, misalnya dengan EDANS. Eksitasi Dabsyl pada 436 nm.

4-Dimethylamino-1-naftalena-sulfonil, suatu fluorofor yang terikat pada gugus amino, eksitasi pada 342 nm, emisi pada 562 nm.

L-, -Asam diaminopropionat (Dap atau Dpr) adalah asam ,ω-diamino, yang merupakan analog lebih pendek dari asam diaminobutyric (Dab), ornithine (Orn), dan lisin (Lys). Turunan asam ,ω-diamino yang dimodifikasi dapat diubah secara selektif pada posisi Nω atau digabungkan untuk membuat peptida bercabang atau dendrimer.

1-(4,4-Dimetil-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)ethyl (Dde) adalah gugus pelindung amino yang digunakan dalam sintesis peptida. Ia dapat dibelah secara selektif menggunakan 2% hidrazin hidrat dalam dimetilformamida (DMF). Nω-Dde memungkinkan penghilangan Dde secara spesifik dari asam amino seperti Dap, Dab, Orn, atau Lys setelah sintesis peptida fase padat (SPPS) Fmoc, memfasilitasi modifikasi resin dari gugus Nω-amino.

Ikatan disulfida merupakan ikatan kovalen yang terbentuk antara dua gugus sulfhidril (-SH) residu sistein dalam protein.

2,4-dimetoksibenzil adalah gugus pelindung formamida yang tidak tahan asam yang digunakan untuk modifikasi tulang punggung reversibel dalam sintesis peptida. Mereka digabungkan selama sintesis peptida fase padat (SPPS) sebagai asam amino atau dipeptida Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), di mana Fmoc mencegah agregasi peptida dan dengan demikian mendorong pemanjangan yang efisien. Dmb juga mendorong reaksi siklisasi dan mencegah pembentukan asparagimida. Berbeda dengan turunan Hmb, Dmb tidak membentuk benzoxazepine selama aktivasi.

2,4-Dinitrofenil adalah kromofor yang terkonjugasi menjadi gugus amino, biasanya digunakan sebagai pemadam dalam substrat transfer energi resonansi fluoresensi (FRET).

4,4′-Dimethoxydityl, juga dikenal sebagai bis-(4-methoxyphenyl)methyl, adalah gugus pelindung karboksamida yang labil asam dan kompatibel dengan sintesis peptida fase padat (SPPS) Fmoc.

DOPA, 3,4-dihidroksifenilalanin, adalah prekursor beberapa neurotransmiter penting, termasuk dopamin, norepinefrin, dan epinefrin.

(4,7,10-Tricaboxymethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecyl)-acetic acid, disingkat DOTA, adalah khelator siklik yang biasanya melekat pada ujung-N peptida. DOTA memfasilitasi pelabelan peptida dengan radionuklida seperti 68Ga atau 90Y untuk berbagai aplikasi biomedis, termasuk pencitraan dan terapi bertarget.

Diphenylmethyl (dityl), suatu gugus pelindung N, O-, dan S yang labil terhadap asam.

Asam dietilenatriaminepentaasetat (DTPA) adalah zat pengkhelat yang berguna untuk radionuklida seperti (68)Ga, (99m)Tc dan (111)In, yang dapat diterapkan pada pencitraan kedokteran nuklir.

5-[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-asam sulfonat (EDANS) adalah fluorofor yang umumnya berikatan dengan Nω asam diamino seperti lisin. Ini sering digunakan pada substrat FRET, biasanya dipasangkan dengan quencher seperti DABCYL. EDANS memiliki panjang gelombang eksitasi 340 nm dan memancarkan pada 490 nm.

Polipeptida pengaktif monosit endotel.

Etil, gugus alkil dan homolog metil (Me), digunakan untuk modifikasi etilasi N dan S permanen dalam peptida.

Pemetaan epitope (antigen epitope maping) adalah teknik yang digunakan untuk menentukan area spesifik (yaitu epitop antigen) pada suatu antigen yang dapat dikenali oleh antibodi atau sistem kekebalan tubuh. Epitop antigen dapat dibagi menjadi epitop linier dan epitop konformasi. Melalui pemetaan epitop antigen, kita dapat memahami secara mendalam hubungan antara struktur dan fungsi antigen, yang sangat penting dalam pengembangan vaksin, diagnosis penyakit, imunoterapi, dan aspek lainnya.
Beberapa metode pemetaan epitop antigen yang umum digunakan meliputi:
Kristalografi sinar-X: Dapat secara langsung menganalisis struktur tiga dimensi antigen, sehingga menentukan posisi epitop.
Resonansi magnetik nuklir: Ini juga dapat digunakan untuk menganalisis struktur antigen untuk menentukan epitop.
Teknik pemindaian peptida: Menggunakan serangkaian segmen peptida sintetik yang tumpang tindih untuk mengidentifikasi epitop yang berikatan dengan antibodi.
Misalnya, dalam penelitian dan pengembangan vaksin, memperjelas epitop utama antigen membantu merancang vaksin yang lebih efektif dan mendorong respons imun yang lebih tepat sasaran; dalam diagnosis penyakit, penentuan epitop antigen yang berkaitan dengan penyakit tertentu dapat mengembangkan reagen diagnostik yang lebih akurat.

5-FAM (5-Carboxyfluorescein) adalah fluorofor yang biasa digunakan untuk memberi label biomolekul, dengan panjang gelombang eksitasi 490 nm dan emisi pada 520 nm.

Fluorescein-6-karbonil adalah fluorofor yang terikat pada gugus amino, dengan panjang gelombang eksitasi 490 nm dan emisi pada 520 nm.

Fluorescein isothiocyanate (FITC) adalah fluorofor yang bereaksi dengan gugus amino. Saat menandai peptida di terminal-Nnya dengan FITC, spacer seperti -alanine atau Ahx biasanya dimasukkan. FITC memiliki panjang gelombang eksitasi 490 nm dan emisi pada 520 nm.

9-Fluorenilmetil adalah kelompok pelindung labil basa yang digunakan untuk perlindungan O dan S.

FMK, fluoromethyl ketone, adalah penghambat RSK2 kinase yang ireversibel.

9-Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), gugus pelindung amino dalam sintesis fase padat FMOC, dapat dihilangkan dengan 20% piperidine/DMF.

Formil adalah kelompok pelindung indol yang digunakan dalam Boc-SPPS. Trp(For) dibelah oleh HF dengan adanya merkaptan atau basa seperti piperidin.

Transfer energi resonansi fluoresensi (FRET) adalah transfer energi nonradiatif dari fluorofor tereksitasi (donor) ke akseptor yang sesuai (pemadam). Perpindahan ini bergantung pada jarak, orientasi dipol, dan tumpang tindih spektral donor dan akseptor. Dalam substrat FRET, fluorofor dan pemadam dihubungkan melalui rantai peptida. Pembelahan enzimatik meningkatkan fluoresensi dengan memisahkan donor dan akseptor.

Fluoresensi adalah cahaya yang dipancarkan oleh suatu zat yang menyerap cahaya atau radiasi elektromagnetik lainnya. Hal ini terjadi ketika molekul yang disebut fluorofor menyerap foton dengan panjang gelombang tertentu, menjadi tereksitasi, lalu memancarkan foton dan kembali ke keadaan dasarnya. Cahaya yang dipancarkan biasanya memiliki panjang gelombang yang lebih panjang dan energi yang lebih rendah dibandingkan cahaya yang diserap, sehingga menghasilkan spektrum fluoresensi yang khas. Fenomena ini banyak digunakan untuk berbagai tujuan ilmiah dan medis, termasuk mikroskop, flow cytometry, dan spektroskopi fluoresensi.

Polipeptida penghambat lambung (GIP), juga dikenal sebagai peptida insulinotropik yang bergantung pada glukosa, termasuk dalam keluarga hormon sekretin. Ini merangsang sekresi insulin, menghambat sekresi asam lambung, dan memainkan peran penting dalam mengatur sekresi insulin dan homeostasis glukosa.

L- -Asam karboksiglutamat (Gla) terbentuk melalui karboksilasi asam glutamat pasca-translasi, menghasilkan protein yang mampu mengikat ion kalsium, seperti osteokalsin. Peptida yang mengandung gla idealnya disintesis menggunakan sintesis peptida fase padat Fmoc (SPPS), karena Gla dapat mengalami dekarboksilasi untuk menghasilkan asam glutamat dengan adanya asam kuat.

Peptida mirip glukagon adalah anggota superfamili glukagon dari hormon peptida yang berasal dari kawasan terminal C proglucagon. Mereka terutama disintesis oleh sel L usus.

Hormon pelepas gonadotropin (LHRH) adalah hormon dekapeptida yang diproduksi di sel neurosekretori hipotalamus dan dilepaskan secara pulsatil ke dalam sirkulasi portal hipofisis. Sekresi pulsatil sangat penting untuk fungsi reproduksi, perkembangan seksual, dan diferensiasi.

Hormon pelepas hormon pertumbuhan (GHRH), juga dikenal sebagai somatorelin, adalah hormon peptida hipotalamus yang merangsang kelenjar pituitari untuk melepaskan dan mensintesis hormon pertumbuhan.

Hormon pelepas hormon pertumbuhan (GHRH), juga dikenal sebagai somatorelin, adalah hormon peptida hipotalamus yang merangsang kelenjar pituitari untuk melepaskan dan mensintesis hormon pertumbuhan.

Antigen leukosit manusia (HLA) mengacu pada sekelompok protein yang ditemukan pada permukaan sel yang memainkan peran penting dalam pengenalan sistem kekebalan terhadap zat asing. Mereka dikodekan oleh gen kompleks histokompatibilitas utama (MHC) pada manusia dan penting untuk presentasi antigen ke sel T, memungkinkan sistem kekebalan membedakan antara sel mandiri dan sel non-diri. Molekul HLA sangat beragam dan polimorfik, berkontribusi signifikan terhadap respon imun individu dan kerentanan terhadap penyakit autoimun dan penolakan transplantasi.

2-hidroksi-4-metoksibenzil adalah gugus pelindung formamida yang tidak tahan asam yang digunakan untuk modifikasi tulang punggung reversibel dalam sintesis peptida. Ini dimasukkan sebagai asam amino atau dipeptida Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) selama sintesis peptida Fmoc fase padat (SPPS), mencegah agregasi dan memungkinkan ekstensi peptida yang efisien. Hmb juga membantu reaksi siklisasi dan mencegah pembentukan asparagin.

L-Homoarginine adalah homolog dari L-arginine, disingkat Har, dan dapat ditemukan dalam plasma dan urin. Homoarginine adalah hasil guanidinasi lisin, yang juga dapat dilakukan pada peptida dan protein.

Homocitrulline adalah homolog dari L-citrulline, disingkat Hci, dan dapat dideteksi dalam urin manusia.

L-homosistein adalah homolog sistein, disingkat Hcy, dan diproduksi melalui demetilasi metionin. Peningkatan kadar Hcy dalam darah merupakan faktor risiko penyakit kardiovaskular dan neurodegeneratif. Berbeda dengan turunan Cys, turunan Hcy tidak melakukan rasemisasi selama penggandengan, begitu pula -elimin.

Homolog L-leusin, disingkat Hle.

Homophenylalanine, homolog dari fenilalanin, disingkat Hph, adalah komponen ACE dan inhibitor renin. Fmoc-Homophe-OH adalah obat antiinflamasi yang potensial.

L-homoproline atau L-picolic acid, disingkat Pip atau Hpr. Homolog prolin Hpr adalah produk degradasi L-lisin. Kedua enansiomer tersebut dapat dideteksi dalam plasma manusia. Karena residu prolin sangat mempengaruhi konformasi peptida, mengganti Pro dengan Hpr (atau azetidine-2-asam karboksilat (Aze)) dapat memodulasi struktur sekundernya.

L-transhidroksiprolin diproduksi pasca-translasi melalui oksidasi prolin. Hyp adalah komponen utama kolagen dan protein kerang.

Isoserin, isomer dari L-serin, adalah asam -amino.

ivDde, suatu gugus pelindung amino, dapat dideproteksi dan dibelah oleh 2% hidrazin hidrat dalam DMF. ivDde lebih stabil dibandingkan Dde terhadap beberapa kali perawatan piperidin selama Fmoc-SPPS. Nω-ivDde dapat dihilangkan secara selektif dari Dap, Dab Orn, atau Lys, memungkinkan modifikasi on-resin pasca-sintetis dari gugus Nω-amino.

Hemosianin limpet lubang kunci (KLH) adalah metaloprotein multisubunit pembawa oksigen besar yang ditemukan dalam hemolimfa hemosianin limpet lubang kunci raksasa. Sebagai pembawa antigen, KLH biasanya meningkatkan imunogenisitas dan kemampuan fiksasi antigen dengan menggabungkan rangkaian polipeptida target, sehingga secara signifikan mendorong pembentukan antibodi yang efisien, spesifik, dan fungsional.

Hormon pelepas hormon luteinizing (LHRH atau GnRH) adalah hormon dekapeptida yang disintesis oleh sel neurosekretori di dalam hipotalamus dan dilepaskan secara pulsatil ke dalam sirkulasi portal hipofisis. Sekresi pulsatil sangat penting untuk fungsi reproduksi, perkembangan seksual, dan diferensiasi.

Dalam desain dan sintesis peptida, peneliti dapat menyisipkan penghubung antara biotin atau fluoresen dan peptida. Spacer hidrofobik yang umum adalah asam aminoheksanoat (Ahx), dan spacer hidrofilik yang umum adalah poli(etilen) glikol (PEG).

Proses pengeringan beku, yang menghilangkan cairan dari bahan yang peka terhadap panas. Bahan dibekukan, ditempatkan di bawah vakum tinggi, dan disimpan pada suhu rendah. Tekanan yang diciptakan oleh ruang hampa menyebabkan es berubah dari padat menjadi gas tanpa melalui keadaan cair. Peptida biasanya dikirim dalam bentuk bubuk terliofilisasi.

Kromatografi Cair-Spektrometri Massa adalah teknik analisis serbaguna yang mengintegrasikan kromatografi cair dengan spektrometri massa untuk memberikan informasi rinci tentang komposisi dan struktur molekul dalam sampel kompleks.

Peptida Antigenik Berganda. Peptida Antigen Berganda adalah salah satu cara ampuh untuk memproduksi antibodi anti-peptida titer tinggi dan vaksin peptida sintetik.

Spektrometri Massa Desorpsi/Ionisasi Laser Berbantuan Matriks (MALDI-MS) adalah teknik analisis yang digunakan untuk mengukur rasio massa terhadap muatan ion. Ini sangat berguna untuk analisis biomolekul seperti peptida, protein, dan polimer.

Spektrometri massa (MS) adalah teknik analisis canggih yang digunakan untuk mengukur rasio massa terhadap muatan (m/z) ion.

4-Metoksi- -naftilamid, disingkat MNA, adalah fluorofor yang biasanya melekat pada substrat karboksipeptidase di ujung C. 4M NA yang terpecah tereksitasi pada 335-350 nm dan memancarkan pada 410-440 nm

Methoxybenzenesulfonyl (Mbs) adalah gugus pelindung guanidyl yang digunakan dalam sintesis peptida fase padat berbasis Boc (Boc-SPPS). Gugus pelindung ini dapat dideproteksi dengan pembelahan menggunakan hidrogen fluorida (HF).

4-Metilbenzil (Mbzl) adalah gugus pelindung sulfhidril yang digunakan dalam sintesis peptida fase padat berbasis Boc (Boc-SPPS). Mbzl lebih stabil dibandingkan metoksibenzil (Mob) dalam perawatan asam trifluoroasetat (TFA) yang sering dan dapat dihilangkan dengan pembelahan hidrogen fluorida (HF).

(7-Methoxycoumarin-4-yl)acetic acid (Mca) adalah fluorofor yang dapat dihubungkan dengan gugus amino.
Mca berikatan dengan dinitrofenil (Dnp) untuk substrat transfer energi resonansi fluoresensi (FRET). Panjang gelombang eksitasi adalah 325 nm, dan panjang gelombang emisi adalah 392 nm.

Hormon konsentrasi melanin (MCH) adalah neuropeptida siklik yang pertama kali diisolasi dari ikan dan tikus. KIA terutama terlibat dalam pengaturan pigmentasi kulit pada ikan teleost dan perilaku makan pada mamalia.

Metil, substituen alkil paling sederhana, terlibat dalam metilasi N-, O-, dan S, yang merupakan modifikasi permanen peptida.

3-Metoksisuksinil, yang sesuai dengan Asp(OMe) terdeaminasi, adalah gugus penghambat terminal-N polar yang umumnya dimasukkan ke dalam substrat karboksipeptidase.

Metilasi adalah modifikasi pasca-translasi (PTM) peptida dan protein di mana gugus metil (-CH3) ditambahkan secara enzimatik ke residu asam amino tertentu, biasanya lisin (Lys), arginin (Arg), histidin (His), atau glutamat ( Glu). Modifikasi ini secara signifikan dapat mempengaruhi fungsi, stabilitas, dan interaksi protein dengan molekul lain, sehingga memainkan peran penting dalam mengatur beragam proses seluler termasuk ekspresi gen, transduksi sinyal, dan interaksi protein-protein.

Kompleks histokompatibilitas utama (MHC) adalah wilayah genetik yang mengandung gen yang mengkode molekul MHC. Molekul-molekul ini memainkan peran penting dalam sistem kekebalan dan autoimunitas. Pada manusia, kompleks ini juga dikenal sebagai sistem antigen leukosit manusia (HLA).

Molekul MHC kelas I (MHC I) adalah protein pada permukaan sel yang menyajikan peptida dari dalam sel ke sel T sitotoksik. Ini membantu sel-sel kekebalan mengenali dan menghancurkan sel-sel yang terinfeksi atau abnormal, yang penting untuk pertahanan kekebalan terhadap patogen dan kanker.

Molekul MHC kelas II (MHC II) merupakan protein permukaan sel yang menyajikan peptida yang berasal dari zat asing ke sel T pembantu. Interaksi ini penting untuk mengoordinasikan respon imun dan mengaktifkan sel imun lain melawan patogen.

Arginin monometilasi (MMA) adalah modifikasi pasca-translasi di mana gugus metil tunggal (-CH3) ditambahkan secara enzimatis ke nitrogen guanidino dari residu arginin dalam peptida atau protein

3-mercaptopropylamine, dapat digunakan sebagai ligan atau pengubah peptida dalam berbagai aplikasi biokimia dan biomedis.

Miristoylasi adalah proses modifikasi lipid di mana gugus miristoil, yang terdiri dari asam lemak jenuh karbon 14-, terikat secara kovalen dengan ujung-N peptida. Modifikasi ini berfungsi untuk mengikat protein ke membran sel, memfasilitasi lokalisasi dan partisipasinya dalam beragam proses seluler.

-(1-naftil)-L-alanin adalah turunan asam amino nonpolar yang mirip dengan fenilalanin, tetapi dengan gugus naftil, bukan gugus fenil.

-(2-Naftil)alanin adalah turunan asam amino nonpolar yang mirip dengan fenilalanin, tetapi dengan gugus naftil, bukan gugus fenil.

3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazole (NBD) biasanya dimasukkan dengan mengkonjugasikan reagen NBD-Cl ke peptida. Peptida berlabel NBD banyak dipilih karena kegunaannya dalam penelitian yang berfokus pada membran dan biologi sel.

N-Etilamida dapat dianggap sebagai bentuk dekarboksilasi dari alanin terminal-C. Dalam buserelin agonis LHRH, NHEt berfungsi sebagai analog dari C-terminal glisinamida. Peptida N-etilamida tahan terhadap degradasi oleh karboksipeptidase.

L-norleucine (Nle) adalah isostere stabil dari L-metionin. Ketika aktivitas biologis peptida terganggu karena pembentukan sulfoksida, Nle dapat menggantikan Met tanpa mengubah perilaku fungsionalnya.

NOTA, 1,4,7-triazacyclononane-1,4,7-triacetic acid, adalah khelator bifungsional yang berfungsi sebagai kerangka kerja untuk membuat alat pencitraan PET. Ini juga digunakan dalam desain probe dan penguatan sinyal melalui efek multivalen dan memiliki aplikasi potensial sebagai radiofarmasi galium diagnostik.

N-Me biasanya mengacu pada N-metilasi, suatu modifikasi kimia di mana gugus metil (-CH 3 ) melekat pada atom nitrogen dalam molekul, seperti N-Me-Gly, N-Me-Ser, N -Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val , N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, dll.

NODAGA,1,4,7-triazacyclononane,1-asam glutarat-4,7-asam diasetat, adalah khelator bifungsional yang luar biasa untuk desain dan pengembangan radiofarmasi organologam, menawarkan manfaat yang signifikan potensi untuk aplikasi dalam pencitraan diagnostik dan radioterapi yang ditargetkan.

2-Nitrophenylthio (Nps) adalah gugus pelindung S yang digunakan dalam sintesis peptida fase padat berbasis Boc (Boc-SPPS). Ia dapat dibelah oleh tiol, khususnya melalui gugus sulfhidril bebas sistein (Cys), yang mengarah pada pembentukan ikatan disulfida secara simultan.

Neuropeptida Y (NPY) adalah neuropeptida yang menonjol di otak dan bagian dari keluarga neuropeptida Y, yang mencakup polipeptida pankreas (PP) dan peptida YY (PYY).

2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) adalah gugus pelindung S yang kompatibel dengan sintesis peptida fase padat berbasis Boc (Boc-SPPS). Npys dapat dibelah oleh tiol, khususnya melalui gugus sulfhidril bebas sistein (Cys), menghasilkan pembentukan ikatan disulfida secara simultan.

Norvaline adalah asam amino alifatik nonpolar dan homolog asam -aminobutyric (Abu).

-Naftilamid adalah fluorofor yang biasa digunakan dalam substrat karboksipeptidase, biasanya dihubungkan pada terminal-C peptida. NA yang terpecah tereksitasi pada 330 nm dan memancarkan pada 370 nm.

-Naftilamid adalah fluorofor yang biasa digunakan dalam substrat karboksipeptidase, biasanya dihubungkan pada terminal-C peptida. Membelah NA pada 320-340 nm, emisi pada 410-420 nm.

Allyl ester adalah gugus pelindung karboksil yang kompatibel dengan sintesis peptida fase padat (SPPS) berbasis Fmoc dan Boc. Mirip dengan Aloc, alil ester dapat dihilangkan secara selektif melalui perlakuan dengan Pd(PPh3)4. Dalam Fmoc-SPPS, Asp(OAll) rentan terhadap pembentukan aspartimida yang dikatalisis basa.

Benzil ester, suatu gugus pelindung karboksil, dapat dihilangkan dengan hidrogenasi katalitik (misalnya H2/Pd) atau asam kuat.

OcHex adalah gugus pelindung karboksil standar yang digunakan dalam sintesis peptida fase padat berbasis Boc (Boc-SPPS).

4-(N-[1(4,4-Dimetil-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-ethylbutyl]amino)benzyl ester (ODmab) adalah pelindung karboksil kelompok yang digunakan dalam sintesis peptida fase padat berbasis Fmoc (Fmoc-SPPS). Ia dapat dibelah dan dideproteksi menggunakan 2% hidrazin hidrat dalam DMF.

2,4-Dimetoksibenzil ester adalah gugus pelindung karboksil yang sangat labil terhadap asam yang dapat dihilangkan menggunakan 1% TFA dalam diklorometana.

Etil ester, Karena kondisi ketat yang diperlukan untuk menghilangkan etil ester, memodifikasi peptida dengan etil ester dapat meningkatkan lipofilisitas dan stabilitasnya.

9-Fluorenilmetil ester adalah gugus pelindung karboksil yang labil basa dan dapat dihilangkan menggunakan piperidin dalam DMF.

Heksil ester, Karena kondisi ketat yang diperlukan untuk menghilangkan etil ester, memodifikasi peptida dengan etil ester dapat meningkatkan lipofilisitas dan stabilitasnya.

L-Otahydroindole-2-asam karboksilat (Oic) adalah asam amino terhambat nonpolar. Penyisipan asam amino terkait prolin ini ke dalam rangkaian polipeptida sangat mempengaruhi konformasi peptida.

Metil ester adalah gugus pelindung terminal-C semi permanen dalam sintesis fase cair, dan dapat diubah menjadi peptida hidrazida, prekursor azida peptida reaktif. Kopling azida tetap menjadi metode penggandengan fragmen yang paling populer dalam sintesis peptida fase cair.

3-Metilpent-3-il ester (OMpe) adalah gugus pelindung karboksil yang labil terhadap asam yang sering digunakan untuk melindungi gugus karboksil asam aspartat (Asp) dalam sintesis peptida fase padat berbasis Fmoc (Fmoc-SPPS ). Analog tert-butil ester yang lebih menuntut secara sterik ini dikembangkan secara khusus untuk mengurangi pembentukan asparagimid yang dikatalisis basa.

Ester orto-nitrofenil dari asam Boc- atau Z-amino adalah turunan terpraaktif yang digunakan dalam sintesis larutan peptida.

Ornithine (Orn) dihasilkan dari arginin selama siklus urea dan juga dapat diamati dalam peptida sebagai produk degradasi arginin. Pembentukan orn melalui asilasi bagian guanidin dari arginin adalah reaksi samping yang umum dalam sintesis peptida.

Ester hidroksisuksinimida (OSu, disingkat NHS) merupakan turunan asam amino terpraaktif yang biasa digunakan dalam sintesis peptida, khususnya modifikasi peptida. Ester OSu aman, non-sterik, kompatibel dengan sistem berair dan mudah ditangani.

Tert-butil ester, gugus pelindung karboksil yang labil terhadap asam untuk asam amino dalam sintesis peptida.

4-asam aminobenzoat (asam para-aminobenzoat), Dapat digunakan untuk sintesis penghubung konjugat antibodi-obat. Misalnya, Mal-PEG2-Val-Cit-PABA adalah penghubung konjugat obat antibodi (ADC) yang dapat dibelah.

PABC (para-aminobenzyl karbamat) adalah senyawa kimia yang digunakan dalam sintesis konjugat obat antibodi (ADC) sebagai penghubung. Teknologi ini memfasilitasi pelekatan obat pada antibodi secara terkendali, sehingga memungkinkan pemberian obat yang ditargetkan dalam terapi kanker dan aplikasi biomedis lainnya. Misalnya, Mc-Val-Cit-PABC-PNP adalah penghubung yang dapat dibelah cathepsin yang digunakan dalam konjugat obat-antibodi (ADC).

Polipeptida pengaktif adenilat siklase hipofisis (PACAP) adalah neuropeptida yang sangat terkonservasi yang diekspresikan secara jelas di seluruh otak mamalia. Ini memberikan efek biologisnya dengan meningkatkan tingkat AMP siklik intraseluler melalui interaksi reseptor.

Palmitoyl, gugus asil nonpolar yang dimasukkan di ujung atau samping N. Palmitoylasi juga telah diamati sebagai modifikasi protein pasca-translasi.

Resin metil fenilasetamida adalah resin yang dirancang khusus untuk sintesis peptida fase padat berbasis Boc (Boc-SPPS). Peptida yang disintesis pada resin ini dapat dilepaskan menggunakan pembelahan HF.

Dalam Konjugat Antibodi-Obat (ADC), penghubung menghubungkan antibodi ke muatan sitotoksik. Pilihan muatan sangat penting karena menentukan efektivitas dan spesifisitas ADC dalam memberikan terapi ke jaringan target melalui mekanisme pelepasan spesifik.

2,2,4,6,7-Pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl (Pbf) adalah gugus pelindung guanidino pilihan yang digunakan dalam sintesis peptida fase padat berbasis Fmoc (Fmoc-SPPS). Ini menunjukkan labilitas asam yang sedikit lebih tinggi dibandingkan dengan Pmc.

Penisilamin adalah analog L-sistein yang ditandai dengan substitusi gugus metil (-CH3) dengan asam karboksilat (-COOH).

Perakitan sendiri peptida adalah saat peptida secara alami menyusun dirinya menjadi struktur yang teratur tanpa campur tangan pihak luar. proses ini didorong oleh interaksi non-kovalen seperti ikatan hidrogen, interaksi hidrofobik, gaya elektrostatis, dan penumpukan π-π. Perakitan peptida dapat mengarah pada pembentukan berbagai struktur nano termasuk serat, bola, lembaran, dan gel, yang dapat diterapkan dalam ilmu material, bioteknologi, dan kedokteran.

Phenylacetyl (Phenylac atau Phac) adalah gugus asil yang biasanya terikat pada ujung N peptida, ditandai dengan polaritas yang lebih rendah dibandingkan dengan asetil (Ac). Ini merupakan modifikasi permanen peptida.

fenilglisin (Phg) adalah turunan asam amino di mana gugus fenil menggantikan atom hidrogen dalam molekul glisin

Peptide Histidine Isoleucine (PHI), peptida babi yang berhubungan dengan VIP dan sekretin.

Peptida histidin metionin (PHM), peptida manusia yang berhubungan dengan VIP.

Titik isoelektrik (pI) didefinisikan sebagai tingkat pH di mana protein/peptida memiliki muatan bersih nol (Smoluch et al., 2016).

2,2,5,7,8-Pentamethylchroman-6-sulfonil (Pmc) adalah gugus pelindung guanidinil yang biasa digunakan dalam sintesis peptida fase padat berbasis Fmoc (Fmoc-SPPS). Ia terkenal karena sedikit kurang labil terhadap asam dibandingkan dengan Pbf.

p-Nitroaniline, sebuah kromofor, biasanya terkonjugasi ke terminal-C substrat karboksipeptidase. Penyerapan p-nitroanilin yang dibebaskan biasanya diukur pada panjang gelombang sekitar 405 atau 410 nm.

L-Propargylglisin (Pra) diproduksi oleh mikroorganisme. Asam amino ini, yang dicirikan oleh struktur ikatan rangkap tiganya, sangat dianggap sebagai unit dasar untuk mensintesis peptida yang mampu terlibat dalam reaksi "kimia klik", sehingga mendapatkan perhatian yang signifikan di lapangan.

Hormon paratiroid (PTH) adalah hormon peptida yang dilepaskan oleh kelenjar paratiroid, penting untuk menjaga homeostasis kalsium dan fosfor dalam cairan ekstraseluler.

Modifikasi pasca-translasi (PTM) protein menambah gugus fungsi atau protein, memotong subunit pengatur, atau memecah seluruh protein. Perubahan-perubahan ini, seperti fosforilasi, glikosilasi, metilasi, asetilasi, lipidasi, ubiquitinasi, nitrosilasi, dan proteolisis, memengaruhi cara kerja sel secara normal dan selama penyakit. Memahami PTM sangat penting untuk penelitian dasar dan menemukan pengobatan baru.

asam piroglutamat, juga dikenal dengan singkatan seperti Pgl, Glp, pGlu, atau

phenylazobenzylmethoxycarbonyl adalah gugus pelindung N kromoforik yang digunakan dalam sintesis peptida, dapat dibelah dengan hidrogenasi katalitik atau asam kuat. Ini menunjukkan panjang gelombang serapan maksimum pada 229 nm, 320 nm, dan 441 nm.

Sepasang quencher terdiri dari molekul fluoresen (fluorofor) dan molekul quencher yang digunakan dalam penelitian dan pengujian berbasis fluoresensi. Pemadam menyerap cahaya yang dipancarkan oleh fluorofor, mengurangi fluoresensinya. Ketika fluorofor dan pemadam dipisahkan, misalnya melalui reaksi biokimia, sinyal fluoresensi meningkat. Hal ini memungkinkan peneliti mengukur perubahan dan interaksi secara real-time. Teknik ini umumnya digunakan dalam aplikasi seperti PCR waktu nyata, probe molekuler, dan pengujian FRET (Förster Resonance Energy Transfer).

Fluor-18 adalah radioligan yang biasa digunakan dalam pencitraan PET untuk menilai metabolisme glukosa dalam jaringan dan umumnya digunakan dalam diagnosis kanker dan pencitraan otak.

Perpustakaan peptida acak adalah kumpulan dari banyak rangkaian peptida pendek yang dihasilkan secara acak. Setiap peptida di perpustakaan memiliki sejumlah asam amino tertentu dengan urutan yang ditentukan secara acak, sehingga menciptakan beragam molekul peptida. Para peneliti menggunakan perpustakaan ini untuk menyaring peptida dengan sifat spesifik, aktivitas biologis, atau interaksi dengan molekul target. Mereka sangat berguna dalam penemuan obat, imunologi, dan studi interaksi protein-protein, membantu mengidentifikasi terapi baru dan memahami proses biologis yang kompleks.

Residu adalah asam amino individu dalam peptida atau protein. Ketika asam amino bergabung melalui ikatan peptida untuk membentuk rantai ini, setiap unit asam amino disebut residu. Istilah ini digunakan karena selama pembentukan ikatan peptida, setiap asam amino kehilangan molekul air (H2O), meninggalkan apa yang disebut residu.

Resin adalah polimer tidak larut yang digunakan dalam sintesis peptida fase padat (SPPS) sebagai pendukung padat untuk penambahan asam amino secara terus menerus. Manik-manik resin memberikan permukaan yang stabil dan lembam di mana asam amino awal terikat secara kovalen, memungkinkan rantai peptida dibangun residu demi residu.

Rhodamin B adalah pewarna merah muda cerah hingga merah dengan panjang gelombang eksitasi biasanya sekitar 540-570 nm dan rentang cahaya yang dipancarkan 560-580 nm. Biasanya terkonjugasi ke urutan peptida melalui gugus amino terminal-N dari peptida

Kromatografi cair kinerja tinggi fase terbalik.

Hubungan Struktur-Aktivitas (SAR) obat dikembangkan dengan mempelajari hubungan antara struktur kimia suatu obat dan aktivitas biologisnya.

Sarcosine, asam amino N-alkilasi paling sederhana.

Dimetilarginin simetris(SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (simetris) dapat langsung digunakan untuk sintesis peptida yang mengandung dimetilarginin simetris.

Sintesis peptida fase padat (SPPS) adalah metode sintesis kimia peptida, di mana peptida dirakit secara bertahap pada penyangga padat atau resin dengan menambahkan asam amino terlindungi secara berurutan. SPPS mencakup dua strategi: Fmoc-SPPS dan Boc-SPPS, yang berbeda dalam pilihan kelompok pelindung gugus N-amino (Fmoc atau Boc) dan kelompok pelindung rantai samping. Jenis gugus pelindung N-amino yang dipilih menentukan strategi perlindungan rantai samping dan kondisi pembelahan akhir peptida dari resin.

Statin, disingkat Sta, merupakan asam amino non-protein yang sering digunakan dalam desain mimetik peptida, terutama dalam sintesis protease inhibitor.

Tert-Butylthio (StBu) adalah gugus pelindung S yang dibelah dengan reduksi fosfin dan kompatibel dengan Boc-SPPS.

Suksinil adalah modifikasi terminal-N polar yang berhubungan dengan aspartat terdeaminasi dan biasanya dimasukkan ke dalam substrat karboksipeptidase.

TAMRA, juga disingkat TMR, adalah fluorofor yang dapat terikat pada gugus amino. Ini sering digunakan dalam kombinasi dengan FAM untuk substrat FRET. TAMRA memiliki panjang gelombang eksitasi 485 nm dan panjang gelombang emisi 535 nm.

Tert-butil adalah gugus pelindung tahan asam yang biasa digunakan untuk alkohol dan fenol, yang dapat dibelah menggunakan asam trifluoroasetat (TFA).

Trietilammonium fosfat adalah buffer yang digunakan dalam fase gerak HPLC fase terbalik.

Asam trifluoroasetat (TFA) digunakan untuk pembelahan peptida dari resin di Fmoc-SPPS dan untuk menghilangkan gugus pelindung yang berasal dari tBu.

Asam trifluoromethanesulfonic (TFMSA) adalah asam yang lebih kuat dari TFA. TFMSA dapat digunakan sebagai alternatif yang lebih aman dibandingkan HF yang sangat beracun untuk langkah pembelahan akhir dari strategi Boc-SPPS.

L-tert-leusin (Tle) adalah asam amino nonpolar dengan rantai samping yang menuntut secara sterik yang mengganggu kestabilan -heliks.

2,4,6-Trimetoksibenzil adalah gugus pelindung Amida Asn dan Gln yang labil terhadap asam yang digunakan dalam Fmoc-SPPS.

Tosil digunakan sebagai gugus pelindung guanidin dan imidazol dalam Boc-SPPS, dan dapat dihilangkan dengan Na/NH3

Trityl (Trt) adalah gugus pelindung yang labil terhadap asam yang digunakan untuk residu Asn, Cys, Gln, dan His di Fmoc-SPPS. Ini dapat dihilangkan secara selektif menggunakan asam trifluoroasetat (TFA).

Peptida murni biasanya berbentuk bubuk putih setelah pengeringan beku.

Peptida usus vasoaktif (VIP) adalah 28-peptida asam amino yang termasuk dalam superfamili peptida glukagon-ghrelin-sekretin.

9-Xanthydryl (Xan) adalah gugus pelindung amide yang labil terhadap asam yang digunakan untuk residu Asn dan Gln dalam Boc-SPPS. Xan dapat dihilangkan secara selektif menggunakan TFA.

Ketika peptida diberi label dengan FAM fluorescein, bubuk terliofilisasi biasanya menunjukkan tampilan kuning.

Z-benzyloxycarbonyl, disingkat Z atau Cbz, digunakan sebagai gugus pelindung amino dalam sintesis peptida. Ini dapat dihilangkan dengan menggunakan hidrogenolisis atau asam kuat seperti HF atau HBr/asam asetat.