Ada dua metode utama untuk sintesis perpustakaan peptida: metode monomer dan metode sub monomer.
Metode monomer
Metode monomer adalah pendekatan tradisional untuk sintesis perpustakaan peptida. Dalam metode ini, semua monomer yang dilindungi harus disintesis terlebih dahulu, dan proses sintesis setiap monomer yang dilindungi rumit dan memakan waktu.
Metode monomer sekunder
Metode monomer sekunder tidak memerlukan monomer dengan gugus alfa amino terlindungi. Metode ini terdiri dari dua langkah: substitusi nukleofilik diikuti asilasi. Metode submonomer memungkinkan penggunaan amina apa pun yang tersedia secara komersial atau tersedia secara sintetik, dengan potensi besar untuk kimia kombinatorial.